In der Dauerausstellung „Tierwelt Brandenburgs - Artenvielfalt einst und heute“ gibt das Museum Einblicke in die Artenvielfalt des Landes Brandenburg. Präparate von Insekten, Fischen, Vögeln und Säugetieren können hautnah bestaunt werden. Die heimischen Fischarten, darunter Hecht, Stör und Wels, sind im Kaltwasseraquarium mit 50-jähriger Tradition zu entdecken. Ausgewählte naturkundliche Aspekte werden in den beiden Sonderausstellungen „In der Spur des Menschen - Biologische Invasionen“ und „Tierisches Leben im UNESCO-Welterbe“ behandelt.